このファイルには外部データベースシステムから取り出している内容を含んでいます (例:EC番号、UniProtキーワード、TIGR機能)。 これらの語句もGO Termと同じように扱っています。 マッピングは手動でつくったものです。詳細はファイルヘッダーを見れば分かります。
マッピングは案内だけに使って下さい。
我々はできるだけ正確を心がけていますが、 GOプロジェクトによってつくられたマッピングが完全であるか、正確であるかということは保証できません。 これはGO Termの定義がないか、外部システムの語句を使ったものがあることによるのかもしれません。 GOオントロジーと外部データベースはマッピングされることによって変更されたからかもしれません。 誤りの報告や代替案の提案はGOヘルプデスクまでお願いします。
external database:term identifier (id/name) > GO:GO term name
外部データベース名:外部データベースでの語句またはID > GO:GO term ; GO:nnnnnnn
詳しくはファイルフォーマットガイドをご覧下さい。メンバーデータベースの各エントリーとGO Termの対応を記述したものです。
例:EC番号データベースとのマッピング
!version: $Revision: 1.72 $ ←バージョン1.72 !date: $Date: 2008/04/02 14:58:46 $ ←アップデート年月日 !Mapping of GO function_ontology "enzymes" to Enzyme Commission Numbers. !original mapping by Michael Ashburner, Cambridge. !This version parsed from function.ontology on 2008/04/01 14:04:04 !by Daniel Barrell, EBI, Hinxton ! EC:1 > GO:oxidoreductase activity ; GO:0016491 EC:1.1 > GO:oxidoreductase activity, acting on CH-OH group of donors ; GO:0016614 EC:1.1.1 > GO:oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor ; GO:0016616 EC:1.1.1.1 > GO:alcohol dehydrogenase activity ; GO:0004022 EC:1.1.1.10 > GO:L-xylulose reductase activity ; GO:0050038 EC:1.1.1.100 > GO:3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase activity ; GO:0004316 EC:1.1.1.101 > GO:acylglycerone-phosphate reductase activity ; GO:0000140 EC:1.1.1.102 > GO:3-dehydrosphinganine reductase activity ; GO:0047560 EC:1.1.1.103 > GO:L-threonine 3-dehydrogenase activity ; GO:0008743 EC:1.1.1.104 > GO:4-oxoproline reductase activity ; GO:0016617 EC:1.1.1.105 > GO:retinol dehydrogenase activity ; GO:0004745 EC:1.1.1.106 > GO:pantoate 4-dehydrogenase activity ; GO:0050166 EC:1.1.1.107 > GO:pyridoxal 4-dehydrogenase activity ; GO:0050235 EC:1.1.1.108 > GO:carnitine 3-dehydrogenase activity ; GO:0047728 EC:1.1.1.11 > GO:D-arabinitol 4-dehydrogenase activity ; GO:0047813 EC:1.1.1.110 > GO:indolelactate dehydrogenase activity ; GO:0047722