プロフィール
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プロフィール

概要

生まれ育ちは奈良。鹿が普通に出没

学歴

年 所属 備考
1976（昭和51）年4月〜1979（昭和54）年3月 東大寺学園幼稚園 自宅近くには公立で2年保育の鼓阪幼稚園と、私立で3年保育の東大寺学園幼稚園があるが、より早くから通わせることができる後者を選択したと母が言っていた。
1979（昭和54）年4月〜1985（昭和60）年3月 奈良市立鼓阪小学校 家から近かったので、8:26ぐらいにひらけ!ポンキッキが終わるのを見てから家を出て走れば朝遅刻せず登校できた。明石家さんまさんの母校でもあるとのこと。
1985（昭和60）年4月〜1988（昭和63）年3月 奈良学園中学校 この他に東大寺学園（受験当時は現在東大寺ミュージアムになっている東大寺南大門の近くにあった）と洛南（付属中学ができて初年度の募集で受験倍率は20倍ぐらいあったと聞く、試験監督が試験が終わってからなぜかロシア語の話をされていたのを覚えている）、計3校を受験。あと奈良教育大付属中学？ 奈良女子大付属中学？ も親は申し込んでたっぽいけど抽選で外れたんだったかな？ とにかく奈良学園だけ受かった。
1988（昭和63）年4月〜1991（平成3）年3月 奈良学園高等学校 高2で理系クラスに入り、理科を2つ選択する際、学年でも超マイナーな物理・生物の組み合わせを選択。センター試験では理科を最大3科目まで受験できたので物理、化学、生物を受験。二次試験はA日程の大阪市立大・理学部、C日程の大阪府立大・工学部、後期日程の神戸大・理学部を受験し全滅。浪人へ。
1991（平成3）年4月〜1992（平成4）年3月 大阪予備校（現在は廃校） 当初はE1クラス（理系の一番上のクラス）、夏の模試の成績がふるわずE2クラスに陥落。昨年に続きセンター試験は理科を3科目受験。二次試験は前期・後期で大阪大・理学部、C日程の大阪府立大（現在の大阪公立大学）・工学部を受験。前期・C日程は不合格で、後期にて第2志望の生物学科でやっと合格。
1992（平成4）年4月〜1996（平成8）年3月 大阪大学理学部生物学科（現在の生物科学科）（学士） サークルは天文同好会。4年での研究テーマは「トリカブト属植物における地理的隔離がおよぼす遺伝的多様性への影響について」（だいたいこんなタイトルだったと思う、現物は手元にないので確認できず）
1996（平成8）年4月〜1997（平成9）年3月 大阪大学大学院理学研究科生物科学専攻博士前期課程（中退） 大学院重点化で定員が増えたこともあってか、院試には一応合格したけど、今後の方向性をもう一度考え直すため入学後すぐ休学（手続きの都合上、休学は5月から）。基礎科学よりは応用寄りのことに関わりたいという思いに至り、次項に進学することとなり、退学。
1997（平成9）年4月〜1999（平成11）年3月 京都大学大学院エネルギー科学研究科
エネルギー社会・環境科学専攻
エネルギーエコシステム学分野（坂 志朗 研究室）修士課程（修士）

職歴

パソコン周辺機器メーカーのバッファローに約5年半勤務し、うち3年余りはネットワーク関連機器を中心にの試作品の検証に、1年余りはPCのしくみや

年 勤務先 主な職務内容
1999（平成11）年4月〜2004（平成16）年10月 株式会社バッファロー（正社員）
  • 製品（主にネットワーク機器）の試作段階において、動作・設計・ユーザビリティに問題がないかの検証を行う（1999年6月〜2001年10月、2004年1月〜10月）。
  • PCの仕組みやネットワーク、サーバ関係の研修講師（2001年11月〜2003年1月）。
  • コンテンツコフィルタ、LAN敷設サービスなどの新規事業立ち上げに関わる業務。（2003年2月〜2003年3月）
  • 無線LAN機器リース事業に関わる生産管理調整、返却品の再生、レンタル品管理システムの運用、経理部門との調整（2003年3月〜2003年12月）

※1999年4月〜5月は新入社員研修期間
2004（平成16）年12月〜2005（平成17）年3月 奈良県川西町三宅町式下中学校組合立式下中学校（常勤講師）
  • 理科の指導
  • 他教科授業における支援学級生徒の支援
2005（平成17）年4月〜2006（平成18）年９月 株式会社メディアテック（正社員）
  • 基本的なPC操作技術の指導（Word、Excelなど）
  • ホームページ製作
2006（平成18）年12月〜2017（平成29）年3月 大阪大学蛋白質研究所
  • 蛋白質情報科学研究系 特任研究員（2006年12月〜2011年3月）/蛋白質データベース開発研究室 特任研究員（常勤）（2011年4月〜2017年3月）
  • 日本蛋白質構造データバンク（Protein Data Bank Japan、PDBj） PDBj国際的な運営高度化グループ
  • PDBj各サービス提供のためのサーバ群管理（RHEL、CentOS）
    • Webサービス
    • FTPサービス
    • rsyncサービス（前項wwPDB共通分と同等コンテンツ）
    • DNSサーバ（pdbj.orgドメイン）
    • NTPサーバ
    • コンテンツ同期
    • 自動バックアップ（MySQL dump、Mediawikiコンテンツバックアップを含む）
    • システム上の警告すべき事項を通知する仕組み作り
    • System Update（RPM Packageの独自ビルド、内部用RPM Repositoryの運営を含む）
  • Webサービスの開発・管理（html、PHP、Gauche）
  • ドキュメント類の執筆、英文和訳、情報発信
  • 一般向け広報（アウトリーチ）活動の企画・運営
2017（平成29）年4月〜2017（平成29）年9月 関西学院大学 理工学部
2017（平成29）年10月〜2020（令和元）年9月 大阪大学蛋白質研究所
2020（令和元）年10月〜現在 大阪大学蛋白質研究所
  • プロテインデータバンク研究室 特任研究員（常勤）
  • 日本蛋白質構造データバンク（Protein Data Bank Japan、PDBj） PDBj/EMDBデータベース高度化グループ

資格・免許

取得日
1993（平成5）年1月7日 普通自動車免許１種
1993（平成5）年12月8日 実用英語技能検定試験２級
1993（平成5）年12月5日 日本語文書処理技能検定３級
1996（平成8）年3月 中学校理科教諭免許１種
1996（平成8）年3月 高等学校理科教諭免許１種
1996（平成8）年12月13日 IPA 情報処理技術者試験２種
1996（平成8）年7月8日 IPA 情報処理技術者試験１種
1997（平成9）年10月31日 国内旅行業取扱主任者試験
1997（平成9）年12月9日 IPA 初級システムアドミニストレータ試験
1999（平成11）年 画像処理技能検定CG部門２級[1]
2002（平成14）年 MCP MCP 70-215
(Installing, Configuring, and Administering Microsoft Windows 2000 Server)
2002（平成14）年12月13日 CompTIA A+ CompTIA A+ (220-221,220-222)
2002（平成14）年12月21日 CompTIA Network+ CompTIA Network+ (N10-002)
2003（平成15）1月10日 IPA テクニカルエンジニア（ネットワーク）
2005（平成17）年 色彩能力検定３級
2006（平成18）年2月26日 日商簿記検定３級
2008（平成20）年 環境社会検定（ECO検定）
2016年（平成28）年 天文宇宙検定2級
2017年（平成29）年9月1日 第二種電気工事士
2019年（平成31）年3月 アクセシビリティリーダー2級
2019年（平成31）年4月 星空宇宙天文検定3級
2022年（令和4）年7月 中国語検定試験3級
  1. CG-ARTS協会（公益社団法人 画像情報教育振興協会）が実施する検定で、現在は5種類・2レベルの検定に再編されている。レベルはベーシックとエキスパートの2レベルで、前者が旧3級、後者が旧2級相当とのこと。

発表、執筆など

  • Gert-Jan BEKKER, 工藤 高裕, 池川 恭代, 山下 鈴子, 栗栖 源嗣,「Protein Data Bankで利用するPDBx/mmCIF形式について」,日本結晶学会誌, (2019) 61(3): pp 159-160, DOI:10.5940/jcrsj.61.159
  • Kaori Nishimura, Nyanta & Kihachi: Story that I heard from my grandmother (English Edition), translated by Takahiro Kudo, Amazon (Kindle e-book) (2019), ASIN: B07WNZ7B6Q（Amazon.co.jp）
    日本語原著：西村 かおり 著『大坂夏の陣―にゃんたときはち』、清風堂書店、2017年、ISBN: 978-4883138685（Amazon）
  • 大阪大学蛋白質研究所 編『どうして心臓は動き続けるの？ - 生命をささえるタンパク質のなぞにせまる』、化学同人、2018年、ISBN:978-4-7598-1981-6（Amazon）
  • David S.Goodsell『生命のメカニズム 原著第2版 -美しいイメージで学ぶ構造生命科学入門-』中村春木 監訳、工藤高裕 西川建 中村春木 訳、シナジー、2015年、ISBN:978-4-916166-62-3（Amazon、セブンネットショッピング、TRCブックポータル、メテオMBC、楽天市場、紀伊國屋ウェブストア）
    英文原著： David S.Goodsell, The Machinery of Life; 2nd ed., Copernicus (2010), ISBN:978-0387849249（Amazon）
  • 工藤高裕,"SCCJ Cafe −Season 4−", Journal of Computer Chemistry, Japan
    • 分子のかたち(1)「蛋白質構造データバンク」,Vol. 13 (2014) No. 4 p. A14-A17 ,doi:10.2477/jccj.2014-0036
    • 分子のかたち(2)「ヘモグロビンをみる」,Vol. 13 (2014) No. 5 p. A21-A24 ,doi:10.2477/jccj.2014-0044
    • 分子のかたち(3)「分子構造の活用」,Vol. 14 (2015) No. 1 p. A3-A5 ,doi:10.2477/jccj.2015-0004
    • 分子のかたち(4)「PDBのデータ書式」,Vol. 14 (2015) No. 2 p. A13-A16 ,doi:10.2477/jccj.2015-0022
    • 分子のかたち(5)「分子閲覧ソフト」,Vol. 14 (2015) No. 5 p. A34-A37 ,doi:10.2477/jccj.2015-0059
  • Tetsuji Okawa, Masanori Yoshida, Takeshi Usui, Takahiro Kudou, Yasumasa Iwasaki, Kazuki Fukuoka, Norio Takahashi, Yuka Uehara and Yutaka Oiso, “A novel loss-of-function mutation of GATA3 (p.R299Q) in a Japanese family with Hypoparathyroidism, Deafness, and Renal Dysplasia (HDR) syndrome.”, BMC Endocrine Disorders (2015) 15:p66, doi:10.1186/s12902-015-0065-7, PubMed:26514990, PMC:PMC4627412
  • Akira R. Kinjo, Hirofumi Suzuki, Reiko Yamashita, Yasuyo Ikegawa, Takahiro Kudou, Reiko Igarashi, Yumiko Kengaku, Hasumi Cho, Daron M. Standley, Atsushi Nakagawa and Haruki Nakamura, "Protein Data Bank Japan (PDBj): maintaining a structural data archive and resource description framework format.",Nucleic Acids Research (2012) 40 (D1): ppD453-D460, doi: 10.1093/nar/gkr811
  • メルコテクノスクール『A+POWER UPテキスト Hardware応用編』 (CompTIA認定資格受験ライブラリー)、DAI-X出版、2003年、ISBN:978-4812522196

居住

年 居住地
1972年4月〜1999年3月 奈良県奈良市
1999年4月〜1999年6月 愛知県名古屋市中村区（住民票はまだ奈良県奈良市）
1999年7月〜2001年10月 愛知県知多市（初の住民票移動）
2001年11月〜2004年5月 三重県亀山市
2004年5月〜2004年10月 愛知県海部郡美和町（現在の愛知県あま市）
2004年10月〜2006年9月 奈良県奈良市
2006年9月〜2007年11月 大阪府箕面市（結婚に伴い転居）
2007年11月〜現在 大阪府池田市

疾患

時期 内容
2004年頃〜 高尿酸血症、2010年頃に1度痛風発作を発症。
2004年9月 血尿が出るので名鉄病院にて診ていただいたところ、同年8月に膀胱腫瘍のあることが発覚。2004年9月2日、県立奈良病院にて経尿道的膀胱腫瘍切除手術（TUR-Bt、尿道から内視鏡と電気メスを入れ膀胱腫瘍を焼き切る手術）を受け膀胱腫瘍を切除。
2005年10月24日 背中にできた大きさ約1cmの表皮嚢腫（粉瘤、アテローム、毛穴の上の皮膚がめくりかえって皮膚の下に袋状構造物ができ角質や皮脂が溜まったもの3）の切除。県立奈良病院にて。
2010年頃 視野の右上がチカチカして頭痛がした。頭のMRIを取ったが異常が見つからず。
2010年頃〜 傾斜乳頭（視神経の束が眼球から出ていく点「視神経乳頭」が斜めになっている状態）。
2010年頃 ジオン注射（ALTA療法）による内痔核の治療。内痔核に注射を行って血流を抑え、腫れを引かせる。池田市のこじまクリニックにて。
2011年 角膜上皮びらん。畑作業をしていて目に杭が当たり、角膜が傷ついた。確か左目。起床時そっと目を開けないと目が痛む症状が数年続いた。
2016年頃 内痔核切除手術。池田市のすぎもとクリニックにて。
2020年〜 2010年頃より視野と眼圧の検査を定期的に受けてきたが、2020年夏から眼圧を下げる点眼薬の使用を開始。自覚症状はないけど左目に緑内障があるらしい。

副業

FIA国際教育アカデミー
大阪市西区にある、中高大学受験（主に帰国生向け受験）、語学資格試験、小論文対策などを主として行っている学習塾。Movable Typeを使ったウェブサイトの運営、更新、ブログ投稿の支援やブログ投稿に添付するPDF資料の作成支援、パソコンのトラブルサポートを行っている。
飯餃人（はんぎょじん）
大阪市住之江区にある飲食店。餃子が看板メニュー。ウェブサイトを作成し提供している。
Cafe Tomobuchi（カフェ トモブチ）
和歌山県紀の川市にある古民家カフェ。ウェブサイトを作成し提供している。