メモ〜タンパク質の構造
index
- タンパク質の概要
- タンパク質の1次構造〜アミノ酸配列
- タンパク質の2次構造〜αらせん、βシート、ターン
- タンパク質
- 20種類のアミノ酸が単位
- アミノ酸がペプチド結合で直鎖状につながったポリペプチド分子がタンパク質
- 複数のポリペプチド鎖(サブユニット)で構成されるタンパク質もある
- 同じアミノ酸配列でも異なる立体構造をとる場合がある
- タンパク質の性質を決める因子1〜アミノ酸の性質(疎水性、親水性、pI、Cysなど)
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タンパク質の性質を決める因子2〜立体構造(モチーフ)
2次構造:αらせん、βシート
超2次構造(モチーフ):
- 機能と構造
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部分構造の分類〜CATH、SCOP、FSSP
- CATH
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クラス(Class)、構造(Architecture)、トポロジー(Topology)、相同スーパーファミリー(Homologous superfamily)の4段階に階層化されている。英国UCL(University College London)内にある「生物分子の構造・モデリンググループ(BSM Group)」(Biomolecular Structure and Modelling Group)にて運営されている。
- SCOP
- FSSP